学术讲座

题目：  CAZyme(碳水化合物活性酶)生物信息学注释资源的开发

Develop CAZyme (Carbohydrate-active enzyme) bioinformatics annotation resource

报告人：尹燕斌 （Northern Illinois University, USA）

时间：2017年12月18日下午 4:00-5:30

地点：信息东楼328室

报告摘要：

In this seminar, I will talk about our efforts in developing new bioinformatics resources for automated CAZyme annotation in any newly sequenced genomes and metagenomes. Carbohydrate-active enzyme (CAZymes) are not only the most important enzymes for bioenergy and agricultural industries, but also very important for human health, in that human gut microbiota encode hundreds of CAZyme genes in their genomes for degrading various dietary and host carbohydrates. CAZymes are found in all living organisms and particularly abundant in plants and plant-associated microbes. CAZyme study has a clear impact in the design of more efficient genetic systems for biofuel and biomaterial production. With more and more genomes of plants and plant-degrading microbes as well as environmental metagenomes sequenced, there is an urgent need for automated CAZyme annotation.

报告人介绍：

报告人简介：

尹燕斌，美国北伊利诺伊大学（Northern Illinois University，USA），终身副教授（associate professor），生物信息学和进化基因组学实验室主任，研究方向为生物信息的软件工具开发、基因组学及其大数据分析。

2005 年在北京大学生命科学学院生物信息中心获生物信息学博士学位，导师为李松岗教授、罗静初教授。随后，在美国纽约州立布法罗大学计算机系、佐治亚大学生物信息研究所先后任博士后和研究科学家，合作导师分别为Daniel Fischer 教授和徐鹰(Ying Xu)教授。2012年起在美国北伊利诺伊大学（Northern Illinois University，USA）任tenure-track 助理教授，2017 年3 月任终身副教授。尹教授近年来研究集中在基因组学及其大数据分析，开发并利用生物信息工具来了解微生物以及植物基因组如何演化并将其应用到生物能源和致病菌研究，在PNAS、Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Plant Physiology、BMC Genomics、BMC Plant Biology 等国际重要学术刊物发表第一或通讯作者论文三十余篇，总计SCI 论文65篇，他引超过2000次。在植物纤维素合成及微生物降解研究领域具有国际声誉。受到美国国立卫生研究院（NIH）和北伊利洛伊大学研究与艺术奖（Research & Artistry Award）的资助，2017 年获得美国国家自然科学基金NSF CAREER Award 奖。